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乳腺癌知识图谱集成了乳腺癌相关的知识/数据资源，包括乳腺癌临床试验数据，乳腺癌医学指南，乳腺癌电子病历，乳腺癌临床试验数据语义标注，乳腺癌医学文献等，数据规模超过两千两百万三元组。

哺乳动物脑结构公共本体(CUMBO)是由国际神经信息学协调委员会神经科学本体项目组共同提出的项目。在参与此项目过程中，中科院自动化所类脑智能研究中心科研人员在公共术语的基础上对哺乳动物脑结构公共本体进行了如下贡献： (1) 脑组织间通过"sub-class of"和 "part-of" 关系进行组织. (2) 为每个术语分配了URI (3)...

此数据集在Allen鼠脑结构本体(Allen Human Brain Atlas Ontology)基础之上，由中科院自动化所类脑智能研究中心进行了如下扩展：(1) 脑组织间通过"sub-class of"和 "part-of" 关系进行组织. (2) 为每个术语分配了URI (3) 为每个术语添加了到DBPedia的链接 (4) 为术语添加了中文翻译

此数据集在Allen人脑结构本体(Allen Human Brain Atlas Ontology)基础之上，由中科院自动化所类脑智能研究中心进行了如下扩展：(1) 脑组织间通过"sub-class of"和 "part-of" 关系进行组织. (2) 为每个术语分配了URI (3) 为每个术语添加了到DBPedia的链接 (4) 为术语添加了中文翻译

通过数据与知识集成、文献自动分析与挖掘，构建的脑科学领域关联知识图谱。图谱包含多尺度的脑结构(脑区、神经元、蛋白质、基因、神经递质)与各种认知功能、脑疾病之间的关联关系。(中国科学院自动化研究所类脑智能研究中心)

面向中药研究，根据中药领域模型的特点，构建了一个包括中医疾病，方剂，中药， 中药化学成分，药理作用，中药实验，化学实验方法在内的中药本体。 进而，基于本体实现了一系列数据库的集成，从而构建了一个中药知识图谱。

探索和研究中国传统的颐养身心，增强体质，预防疾病，延年益寿的理论和方法，并用这种理论和方法指导人们保健活动。系统梳理中医养生方法与体质、证候、疾病等因素之间的关系。

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从中医古籍文献中提取历代医家针对经典名方及其治则、治法、用量和效果的论述。进而构建数学模型， 设计并实现数据分析方法（如知识地图），支持领域专家研究经典名方量效关系的规律。